Grachi 1: La vida Es Maravillosamente Magica

Grachi es una joven que aprenderá a usar sus poderes mágicos, mientras que enfrenta los problemas en su nueva escuela llamada Escolarium, donde tiene que enfrentarse a Matilda, una bruja mala, para conseguir el amor de Daniel. Aparte de ellos, esta Diego quien es un Kanay, una persona que puede controlar los elementos. Además de Matilda, Grachi también debe enfrentarse a la malvada Directora de Escolarium, quien planea apoderarse de los poderes de Grachi, Matilda y Diego, como lo hizo con su hijo Julio, para convertirse en la bruja más poderosa y convertir el Escolarium en un lugar horrible y aburrido. Pero para eso primero tiene que conseguir "El Conjuro Candado" el cual se encuentra en el "Exorem" (un libro de hechizos) y Grachi es la única que puede verlo porque, según la Directora, es la Elegida, la bruja más poderosa. Para lograr derrotar a la Directora, Grachi tendrá el apoyo de su tutora Cussy, su mejor amigo Tony y su MAPS Mecha. En el capítulo final, Grachi une sus poderes con Matilda para vencer a la Directora, queda convertida en perro. Grachi y Matilda parecen perder sus poderes, aunque en el final, aparte de que Grachi termina con Daniel, Grachi logró recuperar sus poderes, ya que hizo frotar una flor e hizo que las paredes del colegio brotaran plantas. Sin embargo, aparece una chica con los ojos naranjas llenos de maldad y odio, que con su presencia hace que de repente se marchiten las plantas que hizo brotar Grachi y también rompe un vidrio con su presencia: ella es Mía, la nueva bruja mala de Escolarium.

Grachi 2: Una Vida de Pura Magia

Un nuevo año escolar comienza para Grachi y sus amigos. Aunque en Ciudad Encantada apenas pasaron un par de meses, en Escolarium muchas cosas cambiaron, Francisco es el nuevo Director del colegio y Escolarium tiene nuevos uniformes diseñados por Mecha. Matilda perdió sus poderes en la fiesta de sus 16 y se hizo novia de Diego durante las vacaciones y Úrsula tiene sus poderes. Grachi tendrá que enfrentarse esta vez a Mía, una nueva bruja que se enamora de Daniel y hará todo con tal de conseguir su amor. Pero también tendrá que enfrentarse a la malvada Athena, una bruja del consejo de magia muy poderosa, la cual hará lo que sea para acabar con Grachi y conseguir el amor de Francisco, y separarlo de Úrsula. Además llega otro nuevo chico a Escolarium llamado Leo un joven "Científico Loco", el cual se enamora de Grachi, lo que significa que se convierta en el principal rival de Daniel. Matilda sigue odiando a Grachi y al igual que Mía, también tiene deseos de destruirla y con un invento de Leo recupera sus poderes. Daniel, debido a que no se puede hallar bien con la nueva entrenadora de los tiburones, decide unirse al equipo rival, los delfines, con tal de seguir nadando y compitiendo. Diego va aprendiendo como usar sus poderes de Kanay. Se encuentra con otra Kanay llamada Kim, poco después de que termino con Matilda. Kim le ofrece a Diego que valla con ella a buscar a los demás Kanays, pero al final lo convence de que su lugar está en la Ciudad Encantada, y que él y Matilda siguán juntos. Tony, quien se suponia que fue a la escuela de ciencias, en realidad fue al mundo de las brujas, donde el tambien es un brujo. En el último capítulo Matilda, Grachi, Diego, Daniel, Mecha, Chema y Tony, se unen para luchar contra Athena, Mía y Leo. Matilda logra encerrar a Athena en una red mágica. Al final Athena es encerrada en la prisión mágica. Grachi y Matilda hacen que Mía pierda la memoria y por lo tanto, ella no se acuerda del hecho de que tiene poderes. Daniel lanza a Leo al agua, y en vista de Leo tiene poderes eléctricos que el mismo se indujo con uno de sus inventos, parece desintegrarse. Francisco y Úrsula por fin se casan. Daniel y Grachi vuelven a estar juntos y prometen que nada los volverá a separar. Después, Grachi tuvo un extraño sueño en el cual siente que es perseguida en un bosque. Al final del trayecto del bosque, Grachi se encuentra con un chico llamado "Axel", que al final se desintegra y se hace cenizas.

Grachi 3: Entre el Amor y la Magia

Grachi empieza a estudiar en E.D.B (Escuela de Brujos) pues deberá perfeccionar y aprender las ciencias mágicas. Aquí conocerá al chico que ha estado apareciendo en sus pesadillas, Axel, quien es un brujo bueno, pero muy rebelde y manipulador como Mía (quien en el pasado fue su novia) y que hará lo que sea con tal de conseguir lo que quiere. Axel tiene como objetivo usar la magia para molestar a los humanos normales, junto con su amigo Manú (Jesús Neyra) a quien le encanta molestar Guardianas, esto lo acercará a Mecha, al punto de que ambos se enamoran. Las cosas se complican cuando Mecha entra a la E.D.B y su nueva asignación como Guardiana es cuidar a Manú. Leo sobrevivió al ser tirado a la laguna pero le crecieron branquias que no le permiten nadar más, así que Leo buscará venganza contra Grachi y Daniel, además planea exterminar a las brujas con un Amuleto hecho de pedazos de un asteroide mágico capaz de debilitar a los brujos. Tony ayuda a Grachi a establecerse en la Escuela de Brujos, pero empieza a obsesionarse con Grachi y la idea de que son "Almas Gemelas" hasta el punto de volverse malvado pero queda encerrado en una polvera mágica para siempre, gracias a Axel. Mía cambia completamente al perder la memoria, pero con ayuda de su mejor amiga del pasado, Amaya, hermana de Axel e idéntica a Valeria, Mía logra recuperar su memoria y empieza a planear su venganza contra Grachi. Matilda se va de Ciudad Encantada a vivir con su abuela. Chema también se va a vivir con sus padres y termina con Mecha, pues le aplicaron el "Conjuro del Olvido" a él también. Grachi descubre que su abuela, Alba, es la Directora de la Escuela de Brujos. Diego empieza a enamorarse de Amaya. Leo termina de construir una máquina del tiempo y por error Grachi y Daniel viajan a 1988 donde Grachi se reencuentra con su madre María Graciela "Maggie", poco después Grachi viaja junto a Axel a 1888 pero cuando son regresados al presente, todos se dan cuenta que en el viaje ambos se hicieron novios ademas de que, Axel se robó el libro que contiene información de "La Elegida". Valeria descubre que es un androide creado por Leo, basado en la apariencia de Amaya, dicho descubrimiento llevará a Valeria a un conflicto interno con su verdadero origen, pero es convertida en ser humano gracias a un conjuro de Grachi, un conjuro que solo "La Elegida" puede recitar y pondrá en duda los límites de Grachi, ya que el balance entre la magia blanca y la magia oscura es muy frágil y se puede romper. Grachi descubre que uno de los clones que ella creó en la 2ª temporada logró quedar materializado y estuvo escondido en la "Secretoteca" donde aprendió a utilizar mejor la magia. En el ultimo episodio, la clon malvada de Grachi es anunciada oficialmente como "La Elegida" en la fiesta de inducción de la E.D.B, pero la verdadera Grachi aparece generando confusión en los presentes. Grachi transporta a todos a un salón quedando solo las dos Grachis, Daniel y Axel. Aparece Mía quien ayudará a Grachi y a Daniel junto con Silvia que se encuentra con el collar puesto pero como ella es un imán de conjuros y tiene mucha energía mágica acumulada, el collar no afecta a los brujos, entonces la Grachi malvada le va a lanzar un podero conjuro a Daniel pero Mía se atraviesa y el conjuro le cae a ella y la debilita. Grachi está apunto de ganarle a su clon pero Axel intentó lanzar un conjuro hacia Grachi así que antes de que pueda hacerlo, Daniel toma el collar del meteorito y se lo amarra a Axel que es transportado violentamente a 1888 otra vez la Grachi malvada se descuida y la verdadera Grachi la amarra con una cuerda mágica y ambas se unen en un solo ser nuevamente. Después Grachi debe tomar su decisión como la nueva líder de los brujos pero en vez de destruir a los humanos y a los Kanays, tal y como decia el libro del pasado, decide unirlos por lo que, todos los estudiantes y maestros de la E.D.B deciden revelar a la gente de Escolarium la verdad y todos empiezan a convivir juntos. Mía queda sin magia por el ataque de la Grachi malvada y Grachi como forma de agradecerle por su ayuda le ofrece devolverle sus poderes pero Mía decide que intentará ser una chica normal por un tiempo. Leo y Valeria le sugieren a Mía que como regalo de cumpleaños, le van a regalar un robot completamente parecido a Daniel pero ella rechaza la oferta. Gracias a la decisión de Grachi de unir a los Brujos, Kanays y Humanos, Amaya y Diego por fin pudieron estar juntos y actualmente se han hecho novios al igual que Manú y Mecha. Grachi menciona que Axel logró adaptarse a 1888. Grachi y Daniel vuelven a estar juntos sabiendo que ya nada los puede separar. En la escena final, Amaya, Diego, Mía, Mecha, Leo, Valeria, Manú, Daniel y Grachi se encuentran conviviendo en "El 7" y Grachi despide la serie diciendo que la vida es "Maravillosamente mágica" y poniendo fin.